Il laboratorio mirava a costruire una pipeline end-to-end di livello professionale, in grado di sincronizzare in loco la propria infrastruttura di sequenziamento long-read<\/strong> con il nostro motore avanzato di interpretazione del microbioma. L’obiettivo era eliminare la gestione manuale dei dati, garantendo che le analisi complesse del microbioma potessero essere eseguite dal personale di laboratorio con totale rigore scientifico, indipendentemente dal loro background bioinformatico. <\/p>\n Il sequenziamento ad alto rendimento produce volumi massicci di dati che richiedono una gestione sofisticata prima di poter essere interpretati<\/strong>. Per molti laboratori, il divario tra la “fine di una corsa” e l'”inizio di un’analisi” \u00e8 spesso colmato da caricamenti manuali e da strumenti frammentati, che possono creare colli di bottiglia operativi con l’aumentare del volume. <\/p>\n La sfida non era solo elaborare i dati, ma farlo in modo scalabile ed efficiente risorse. Per soddisfare la crescente domanda di test sul microbioma, il laboratorio aveva bisogno di un sistema che fungesse da “partner silenzioso”: un’architettura automatizzata in grado di gestire il flusso di informazioni senza richiedere una costante espansione del team di bioinformatica.<\/strong><\/p>\n Sequentia ha implementato un gateway di automazione intelligente progettato per orchestrare l’intero ciclo di vita dei dati. <\/strong>Invece di affidarsi a connettori generici, questa soluzione offre un framework di acquisizione dedicato che monitora gli output del sequenziamento in tempo reale. Immediatamente dopo il basecalling, il sistema acquisisce i file FASTQ e applica filtri di qualit\u00e0 ottimizzati per i dati long-read. <\/p>\n Questo “Smart Bridge” gestisce quindi il trasferimento sicuro e ad alta velocit\u00e0 dei dati tramite API alla nostra piattaforma di analisi, attivando istantaneamente il workflow del microbioma.<\/strong> Questa architettura garantisce:<\/p>\n I report del microbioma vengono generati automaticamente in formato PDF, mentre le dashboard interattive restano disponibili per un’esplorazione pi\u00f9 approfondita a livello di coorte. L’intero workflow \u00e8 stato semplificato in modo pi\u00f9 efficiente, eliminando gli attriti tecnici senza aggiungere oneri finanziari o operativi. <\/p>\n Implementando questo strato di orchestrazione dedicato, Sequentia Biotech ha trasformato la metagenomica long-read in un servizio “chiavi in mano”.<\/strong> La soluzione dimostra che gli strumenti pi\u00f9 potenti sono quelli che si integrano profondamente nell’infrastruttura specifica di un laboratorio.<\/p>\n Il laboratorio pu\u00f2 ora scalare il proprio volume di sequenziamento senza la necessit\u00e0 di ulteriore personale bioinformatico,<\/strong> consentendo una crescita sostenibile e una fornitura del servizio pi\u00f9 rapida. Il risultato \u00e8 un’intuizione del microbioma sofisticata e operativa, fornita con rapidit\u00e0 e affidabilit\u00e0. <\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" Un grande laboratorio europeo di diagnostica clinica aveva gi\u00e0 investito nel sequenziamento long-read Oxford Nanopore (ONT) per supportare i suoi servizi sul microbioma. Per massimizzare il ROI di questa tecnologia, il laboratorio ha collaborato con Sequentia Biotech per implementare uno strato di orchestrazione ad alte prestazioni. Questo ponte specializzato converte l’output grezzo del sequenziamento in report standardizzati pronti per i medici, creando un ecosistema automatizzato ad alta velocit\u00e0 “dal poro al PDF”. <\/p>\n","protected":false},"featured_media":11735,"parent":0,"template":"","meta":{"_acf_changed":false},"customer":[263],"case-studiesomic":[269],"service":[253],"class_list":["post-11921","case-study","type-case-study","status-publish","has-post-thumbnail","hentry","customer-laboratori-di-diagnostica-clinica","case-studiesomic-metagenomica","service-consulenza-bioinformatica"],"acf":[],"yoast_head":"\nSfida<\/h3>\n
Soluzione<\/h3>\n
\n
Impatto<\/h3>\n