Autores: Lucía Álvarez-González, Frances Burden, Dadakhalandar Doddamani, Roberto Malinverni, Emma Leach, Cristina Marín-García, Laia Marín-Gual, Albert Gubern, Covadonga Vara, Andreu Paytuví-Gallart, Marcus Buschbeck, Peter J. I. Ellis, Marta Farré, Aurora Ruiz-Herrera
Instituciones:
- Departamento de Biología Celular, Fisiología e Inmunología, Universidad Autónoma de Barcelona,
Cerdanyola del Vallès, España - Grupo de Integridad e Inestabilidad del Genoma, Institut de Biotecnología i Biomedicina, Universitat Autònoma de Barcelona,
Cerdanyola del Vallès, EspañaGenome Integrity and Instability Group, Institut de Biotecnologia i Biomedicina, Universitat Autònoma de Barcelona, Cerdanyola del Vallès, Spain - Facultad de Biociencias, Universidad de Kent, Canterbury, Reino Unido
- Programa de Epigenética y Biología del Cáncer y la Leucemia, Instituto de Investigación contra la Leucemia Josep Carreras (IJC), Campus ICO-GTP-UAB, Badalona,
España - Sequentia Biotech, Barcelona,
España - Programa de Medicina Predictiva y Personalizada del Cáncer, Instituto de Investigación Germans Trias i Pujol (PMPPC-IGTP), Badalona,
España
Publicación: Nature Communications
Fecha: mayo de 2022
Enlace: 3D chromatin remodelling in the germ line modulates genome evolutionary plasticity
Abstracto:
El plegamiento cromosómico tiene profundos impactos en la regulación génica, cuyas consecuencias evolutivas están lejos de ser comprendidas. Aquí exploramos la relación entre la remodelación tridimensional de la cromatina en células germinales de ratón y los cambios evolutivos en la estructura del genoma. Utilizando un análisis computacional integrativo exhaustivo, (i) reconstruimos siete genomas ancestrales de roedores analizando secuencias genómicas completas de 14 especies representativas de los principales filogrupos, (ii) detectamos reordenamientos cromosómicos específicos del linaje y (iii) identificamos la dinámica de las propiedades estructurales y epigenéticas de las regiones de punto de ruptura evolutivo (EBR) a lo largo de la espermatogénesis del ratón. Nuestros resultados muestran que las EBR carecen de roturas de doble cadena del ADN meiótico programadas (DSB) y cohesinas meióticas en los espermatocitos primarios, pero están asociadas en células postmeióticas con sitios de daño del ADN y regiones funcionales de interacción de largo alcance que recapitulan configuraciones cromosómicas ancestrales. En general, proponemos un modelo que integra la reorganización evolutiva del genoma con los mecanismos de respuesta al daño del ADN y la organización espacial dinámica del genoma de las células germinales.
