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código abierto

Impulsando la ciencia a través del código abierto

En Sequentia Biotech creemos que el progreso científico se acelera mediante la colaboración y la transparencia. Esta creencia es el núcleo de nuestro compromiso con la comunidad bioinformática a través del desarrollo y el soporte de herramientas bioinformáticas de código abierto.

Base de datos de genes de resistencia a plantas

Drago2 y PRG

Drago2 y PRG Disease Resistance Analysis and Gene Orthology (DRAGO 2), es un pipeline in silico para recuperar, anotar y clasificar automáticamente los genes de resistencia a plantas. DRAGO 2 es la herramienta de anotación oficial de PRGdb, la base de datos de genes de resistencia a plantas.

La base de datos de genes de resistencia a plantas es una web de código abierto que ha sido totalmente desarrollada en formato MediaWiki, y representa el primer recurso bioinformático que proporciona una visión general completa de los genes de resistencia en plantas

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Herramienta de descubrimiento y anotación de lncRNA de plantas

Code 0 y GreeNC

Más allá de los genes se encuentra un universo de regulación genética: los ARN no codificantes largos (lncRNAs). Code 0 es nuestro motor de descubrimiento de nueva generación, diseñado para descifrar y anotar lncRNAs en cualquier genoma o transcriptoma de interés.

Code 0 se aplicó para analizar los genomas de aproximadamente 100 especies de plantas y los lncRNAs identificados se organizan y se hacen accesibles en GreeNC, nuestra base de datos completa. Con estas herramientas, capacitamos a la comunidad científica para descifrar nuevas capas de control de la expresión génica y su impacto en la biología.

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Genómica marina para la conservación del pez espada

Swordfishomics

Swordfishomics es un proyecto pionero que se sumerge en las profundidades del genoma del pez espada (Xiphias gladius). Al secuenciar su transcriptoma, hemos creado un recurso público sin precedentes para la comunidad científica y las agencias de conservación.

Este portal de datos abiertos es fundamental para la gestión sostenible de las poblaciones de pez espada en el Mediterráneo, proporcionando información genómica clave para la evaluación de las poblaciones y la biología de las especies.

Fue desarrollado en el marco del proyecto “Evaluación de las poblaciones de Xiphias gladius en el mar Mediterráneo”, encargado por la Universidad Politécnica de Marche (Italia), en colaboración con Cofrepeche y Oceanis, y con el objetivo de proteger nuestros océanos.

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